Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtr1Q9DBC3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms