Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf4Q9DAW6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms