Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms