Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg13Q9D8C3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alg13Q9D8C3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms