Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp2c55Q9D816 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms