Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nsmce1Q9D720 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce1Q9D720 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce1Q9D720 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nsmce1Q9D720 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms