Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tube1Q9D6T1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms