Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmtm5Q9D6G9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms