Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms