Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms