Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc130Q9D516 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc130Q9D516 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc130Q9D516 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc130Q9D516 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc130Q9D516 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc130Q9D516 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc130Q9D516 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc130Q9D516 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc130Q9D516 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc130Q9D516 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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