Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930564D02RikQ9D4S4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms