Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ribc2Q9D4Q1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms