Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pabpc6Q9D4E6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc6Q9D4E6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms