Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrp2bpQ9D4C6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms