Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms