Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Krt20Q9D312 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Krt20Q9D312 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Krt20Q9D312 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Krt20Q9D312 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Krt20Q9D312 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Krt20Q9D312 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Krt20Q9D312 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Krt20Q9D312 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Krt20Q9D312 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Krt20Q9D312 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Krt20Q9D312 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt20Q9D312 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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