Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trappc6bQ9D289 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trappc6bQ9D289 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trappc6bQ9D289 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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