Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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