Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Mrpl28Q9D1B9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Mrpl28Q9D1B9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Mrpl28Q9D1B9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Mrpl28Q9D1B9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Mrpl28Q9D1B9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Mrpl28Q9D1B9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Mrpl28Q9D1B9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Mrpl28Q9D1B9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Mrpl28Q9D1B9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Mrpl28Q9D1B9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Mrpl28Q9D1B9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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