Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms