Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gtf2e1Q9D0D5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms