Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Elp3Q9CZX0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms