Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms