Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms