Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms