Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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