Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pin4Q9CWW6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms