Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ddx28Q9CWT6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ddx28Q9CWT6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ddx28Q9CWT6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ddx28Q9CWT6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ddx28Q9CWT6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ddx28Q9CWT6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ddx28Q9CWT6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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