Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6kQ9CWP4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms