Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Raver1Q9CW46 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Raver1Q9CW46 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms