Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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