Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms