Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms