Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms