Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Commd4Q9CQ02 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms