Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl17Q9CPR4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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