Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrbp1Q99PL5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrbp1Q99PL5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms