Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NsmfQ99NF2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms