Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl43Q99N89 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl43Q99N89 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms