Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SrrtQ99MR6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms