Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Sh3bp5lQ99LH9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Sh3bp5lQ99LH9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Sh3bp5lQ99LH9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Sh3bp5lQ99LH9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Sh3bp5lQ99LH9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Sh3bp5lQ99LH9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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Sh3bp5lQ99LH9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Sh3bp5lQ99LH9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Sh3bp5lQ99LH9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Sh3bp5lQ99LH9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
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Sh3bp5lQ99LH9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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