Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms