Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms