Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SmagpQ99KC7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms