Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms