Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Smim11aQ99J19 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Smim11aQ99J19 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Smim11aQ99J19 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Smim11aQ99J19 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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