Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim59Q922Y2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms