Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms