Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Odf3Q920N1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms